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【佳學基因檢測】RNAseq測序科研服務基因檢測中的質(zhì)量控制和序列拼接

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佳學基因檢測】RNAseq測序科研服務基因檢測中的質(zhì)量控制和序列拼接


基因解碼中的RNAseq為佳學基因提供解析新的變異體、新的序列突變的強大能力,這是為什么采用基因解碼方法進行基因檢測和致病基因鑒定要優(yōu)于數(shù)據(jù)庫比對的根本原因。佳學基因提供的基因解碼分析手段是將研究級別的嚴謹應用于臨床病例的分析中,從而為醫(yī)生將單個病例轉(zhuǎn)化為發(fā)表級數(shù)據(jù)。其中,由佳學基因開發(fā)的單軌分析管道使用標準工具分析RNA-seq數(shù)據(jù)和編制QCr質(zhì)量控制標準。這包括:(a)使用STAR方法以特殊方式使RNA seq序列與參照基因組進行比對。(b)采用比肩seqtk的方法分析堿基信號質(zhì)量并用來分析堿基的組成。(c)以優(yōu)于Megadepth的方法來揭示樣品中的片段長度、在全部染色體的覆蓋率及覆蓋分布,(d)通過featureCounts進行基因表達水平的粗略QC分析。請致電4001601189,以了解關于科研服務中RNA測序中如何獲得表達譜及剪接方式分析。




 

(責任編輯:佳學基因)
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