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【佳學(xué)基因檢測】嬰兒癲癇痙攣綜合征基因檢測病例

【精選基因檢測】嬰兒癲癇痙攣綜合征基因檢測病例 一名10個月大的女嬰因突發(fā)雙側(cè)手臂強直伸展運動一周來到佳學(xué)基因合作醫(yī)院兒科神經(jīng)內(nèi)科就診。該女嬰為四川的一對近親家結(jié)婚的夫婦的第

佳學(xué)基因檢測】嬰兒癲癇痙攣綜合征基因檢測病例


受檢者病情描述及送檢依據(jù)

一名10個月大的女嬰因突發(fā)雙側(cè)手臂強直伸展運動一周來到佳學(xué)基因合作醫(yī)院兒科神經(jīng)內(nèi)科就診。該女嬰為四川的一對近親家結(jié)婚的夫婦的第三個孩子,孕期平安,孕38周出生,體重2.8 kg(16百分位)。出生時常規(guī)頭圍(HC)測量結(jié)果為34 cm(54百分位)。初次就診時,體格檢查顯示其身高(72 cm,58百分位)和體重(9 kg,68百分位)均在正常范圍內(nèi),但存在小頭畸形(42 cm,低于5百分位)。神經(jīng)系統(tǒng)檢查顯示肌張力增高,右踝關(guān)節(jié)痙攣,軸向肌肉不穩(wěn)定,無脫色性皮膚病變,例如低色素斑或咖啡牛奶斑。七個月齡時進行的貝利嬰幼兒發(fā)展量表測試顯示,患者整體發(fā)育嚴(yán)重遲緩,發(fā)育商 (DQ) 得分如下:認(rèn)知 DQ = 55,語言 DQ = 68,運動 DQ = 52。然而,社會情感 (DQ = 80) 和適應(yīng)性行為 (DQ = 84) 得分相對正常。

一周前,她的父母注意到她雙臂突然出現(xiàn)強直伸展運動,其特征性表現(xiàn)為在清醒或入睡時出現(xiàn)明顯的痙攣,每次痙攣發(fā)作 20-30 次?;颊邿o癲癇或神經(jīng)發(fā)育/神經(jīng)精神疾病家族史。

對患者進行了初步評估,以確定癲癇發(fā)作的病因和里程碑式的發(fā)育遲緩。腦MRI顯示彌漫性腦萎縮,以腦脊液腔外擴大、腦溝明顯、胼胝體變薄為特征(圖1)。癲癇發(fā)作期間捕獲了發(fā)作期腦電圖(EEG),其特征是彌漫性棘波、多棘波和多波放電,隨后是電衰減期。發(fā)作間期腦電圖顯示多灶性棘波放電,伴有高振幅背景活動,診斷為高度節(jié)律失常和嬰兒癲癇痙攣綜合征(圖2)?;颊呓邮馨奔合┧嶂委?,起始劑量為50 mg/kg/天,逐漸增加至150 mg/kg/天。然而,由于持續(xù)性癲癇痙攣,開始使用大劑量類固醇進一步治療。經(jīng)胸超聲心動圖和腹部超聲檢查未見異常。

嬰兒癲癇痙攣綜合征基因檢測MRI
圖1:患者腦部磁共振成像 (MRI) 表現(xiàn)?;颊吣X部 MRI 表現(xiàn)。T1 加權(quán)矢狀面圖像 (a) 可見變形的薄胼胝體。彌漫性腦萎縮也很明顯,其特征包括明顯的軸外間隙、體積減小的腦溝明顯以及白質(zhì)髓鞘形成延遲 (b-d)。
嬰兒癲癇痙攣綜合征腦電圖基因檢測
 
患者的腦電圖(EEG)。腦電圖記錄患者出現(xiàn)痙攣樣運動。背景活動幅度相對較高,伴有多灶性棘波或多棘波放電,與高度節(jié)律性失常相符。

圖2:患者在其他機構(gòu)進行的基因檢測是染色體微陣列分析 (CMA),檢測結(jié)果正常。經(jīng)佳學(xué)基因評估后,建議做跨系統(tǒng)致病基因鑒定基因解碼但全外顯子組測序鑒定出一個意義不明確的新生雜合變異 SPTBN1 (c.785A>T; p.Asp262Val)。同時進行了家族桑格測序的系譜分析(圖 3)。根據(jù) ACMG 分類,SPTBN1 變異被重新歸類為疑似致病變異。在 gnomAD v4.0.0 數(shù)據(jù)集中,該變異的等位基因頻率 <0.01。計算機模擬工具預(yù)測表明該變異對基因或基因產(chǎn)物具有破壞性作用 [REVEL:0.94(≥0.6,靈敏度 0.68,特異性 0.92);3Cnet:0.99(≥0.6,靈敏度 0.72,精度 0.9)]。
嬰兒癲癇痙攣綜合征家系圖

圖3: 患者家譜及全外顯子組測序/桑格測序結(jié)果。(a)父親SPTBN1基因桑格測序(野生型)。(b)母親SPTBN1基因桑格測序(野生型)。(c)家族家譜及病例患者SPTBN1突變?nèi)怙@子組測序結(jié)果。

佳學(xué)基因癲癇基因檢測案例說明了什么

佳學(xué)基因的這一案例講述的是一個兒童IESS患者,其攜帶新生SPTBN1 c.785A>T (p.Asp262Val)突變。根據(jù)佳學(xué)基因案例集,SPTBN1突變最初在自閉癥譜系障礙(ASD)患者檢出,但隨后該突變也在患有各種神經(jīng)精神疾病的患者中,例如癲癇、智力障礙、言語障礙、注意力缺陷多動障礙中檢測出來(OMIM#182790)。 IESS是一種極具破壞性的癲癇性腦病,其病因范圍更廣,包括結(jié)構(gòu)性、遺傳性、代謝性或感染性病因,并且其發(fā)育狀況因早期診斷和治療的不同而存在差異。隨著癲癇的致病基因鑒定基因解碼的發(fā)展,佳學(xué)基因已發(fā)現(xiàn)超過28種與IESS相關(guān)的拷貝數(shù)變異和70種單基因致病變異。遺傳變異包括染色體異常(例如21三體綜合征)、單基因疾?。═SC1、TSC2、CDKL5、ARX、KCNQ2、STXBP1和SCN2A)、三核苷酸重復(fù)異常、線粒體異常,以及其他的可能的候選基因。與其他單基因疾病一樣,SPTBN1突變可能是一個候選基因,它與神經(jīng)元發(fā)育和動作電位產(chǎn)生相關(guān)的多種細胞過程有關(guān)。 頻譜蛋白是重要的細胞骨架蛋白,在神經(jīng)系統(tǒng)中普遍表達。編碼神經(jīng)元頻譜蛋白的基因的致病變異,例如SPTAN1、SPTBN1、SPTBN2和SPTBN4,與各種神經(jīng)發(fā)育障礙相關(guān)。在頻譜蛋白家族基因中,SPTBN1 編碼神經(jīng)元 βII-頻譜蛋白,它是腦中最豐富的 β-頻譜蛋白,并形成 αII-頻譜蛋白四聚體,插入 F- 肌動蛋白環(huán),構(gòu)建膜下周期性骨架 (MPS) 。此外,胞質(zhì)中的 βII-頻譜蛋白池促進軸突細胞器雙向運輸。 缺乏 βII-頻譜蛋白的動物模型表現(xiàn)出皮質(zhì)紊亂、發(fā)育遲緩和行為缺陷,而純合敲除則會導(dǎo)致出生后早期死亡。雜合模型表現(xiàn)出較輕但顯著的表型,這表明雜合的 SPTBN1 變異可能同樣會損害神經(jīng)發(fā)育和功能。 βII-頻譜蛋白由兩個鈣調(diào)蛋白同源結(jié)構(gòu)域(CH1 和 CH2)、14–17 個 SR 結(jié)構(gòu)域和一個 PH 結(jié)構(gòu)域組成。變異常聚集在 CH 結(jié)構(gòu)域內(nèi),尤其是 CH2 結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域表現(xiàn)出更高的錯義約束程度 (ExAC v.10),凸顯了其功能重要性。 據(jù)報道,SPTBN1 突變個體的臨床異質(zhì)性在于他們表現(xiàn)出不同程度的神經(jīng)精神定向障礙。此外,14 項基因解碼研究揭示了SPTBN1 突變與神經(jīng)精神疾病之間的關(guān)聯(lián);佳學(xué)基因病案集,已收錄了 60 種變異。突變圖譜如圖4所示。根據(jù)佳學(xué)基因癲癇疾病致病基因鑒定基因解碼病案集,具有致病基因突變的個體中,有91%(55/60)的患者表現(xiàn)為發(fā)育遲緩、智力障礙和/或自閉癥譜系障礙(ASD)。15%(9/60)的個體出現(xiàn)有癲癇,且癲癇相關(guān)突變主要發(fā)生在CH結(jié)構(gòu)域(31.8%,7/22),而非SR結(jié)構(gòu)域(10.3%,4/39)。值得注意的是,另有一名患者攜帶CH2結(jié)構(gòu)域的終止增益突變(c.247C>T;p.Arg83Ter),該突變與嚴(yán)重的癲癇性腦病相關(guān),表現(xiàn)為早期嬰兒癲癇性腦病(EIEE)。



圖4:βII-頻譜蛋白功能域示意圖。CH1(天藍色)、CH2(藍色)、SR(綠色)、PH(黃色)。標(biāo)示了SPTBN1變體的位置。錯義變體(紅色)。終止增益/移碼變體(藍色)、剪接位點變體(深綠色)、同義變體(黃色)、其他變體(黑色)。CH1,鈣調(diào)蛋白同源域1;CH2,鈣調(diào)蛋白同源域2;SR,頻譜蛋白重復(fù)序列??;PH,普萊克底物蛋白同源域;ASD,自閉癥譜系障礙;DD,發(fā)育遲緩;ADHD,注意力缺陷多動障礙;ID,智力障礙;EIEE,早期嬰兒癲癇性腦?。籒,未知。我們病例中的患者也標(biāo)有黑色星號。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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